COVID-19Veille scientifique COVID-19

La veille scientifique signalétique recense les publications et prépublications scientifiques en lien avec la prévention, le contrôle, la clinique et l’épidémiologie de la COVID-19. Elle vise à soutenir les travaux et la prise de décision en offrant un accès accéléré aux nouvelles connaissances sur la COVID-19 aux intervenants, aux acteurs et décideurs de santé publique.

Les nouvelles publications et prépublications scientifiques retenues sont regroupées en catégories et envoyées quotidiennement à 14 h dans le Bulletin de veille scientifique COVID-19.

Présentation générale

Un processus de veille non exhaustive de la littérature scientifique est mené en continu. Les résultats provenant d’un ensemble de sources pertinentes sont captés par un agrégateur de flux RSS puis triés quotidiennement par une équipe formée de conseillères scientifiques et d’un médecin conseil. Les publications et prépublications retenues sont ensuite classées dans différentes thématiques.

La liste des thématiques et de leurs définitions est présentée ci-bas. (L’intitulé de chacune des thématiques peut être cliqué afin de consulter les derniers résultats y appartenant).

Liste des thématiques

  • CHSLD – RPA : éclosions, modes de transmission, gestion des personnes exposées, mesures de prévention et de contrôle des infections, impacts de la vaccination sur ces mesures, etc.
  • Clinique : présentation clinique et durée de la maladie, symptômes persistants, complications, prédicateurs et facteurs de risque de sévérité, réinfection/réactivation, co-infections, etc.
  • Enfants – Femmes enceintes : susceptibilité d’acquérir la COVID-19 par cette population, potentiel de transmission (mère-enfant, enfant-enfant, enfant-adulte), présence des anticorps neutralisants dans le lait maternel, etc.
  • Épidémiologie : méthodes de surveillance, modélisation de la pandémie, effets des conditions météorologiques et de la pollution sur la prévalence et la transmission de la maladie, populations à risque, etc.
  • GCC – Communauté : gestion des cas et des contacts en milieu communautaire (milieux scolaires, camps de jour, contacts domiciliaires, milieux extérieurs, milieux de travail excluants de soins, etc.) : modes de transmission, éclosions, méthodes de traçage des contacts, asymptomatiques, impacts de la vaccination sur la transmission, etc.
  • Laboratoire : tests diagnostic et comparaison des méthodes, types d’échantillonnage, prévalence des faux négatifs.
  • Mesures populationnelles : port de masques et de couvre-visages par la population générale, mesures de confinement, déconfinement/reconfinement, couvre-feu, distanciation physique, etc. 
  • PCI - milieux dentaires : mesures de prévention et de contrôle des infections en milieux dentaires : transmission par les aérosols dentaires, production d’aérosols par les instruments, mesures barrières, équipement de protection, etc.
  • PCI – milieux de soins : mesures de prévention et de contrôle des infections en milieux de soins : prise en charge des travailleurs et usagers exposés, durée et levée de l’isolement, impacts de la vaccination sur les mesures PCI, équipement de protection individuelle, retraitement d’équipement à usage unique, procédure de désinfection, etc.
  • Santé au travail : éclosions en milieux professionnels, modes de transmission, mesures de prévention et de contrôle des infections.
  • Séroprévalence : prévalence et durée des anticorps neutralisants après infection ou en post-vaccination.
  • Traitement : traitement et prise en charge de la COVID-19.
  • Vaccination : effets de la vaccination, mesures sanitaires pour les vaccinés, mesures de protection individuelle, de dépistage ou de confinement qui distinguent les vaccinés des non-vaccinés, mise en place d’un passeport vaccinal, taux de couverture vaccinale à partir duquel les mesures s’assouplissent en milieux de soins et communautaires, perception de la vaccination, etc. 
  • Variants : association entre une ou des mutations et un avantage infectieux, ou des cas cliniques plus sévères, ou une incapacité du système immunitaire à neutraliser le virus, prévalence des variants, effet de la vaccination, etc.

Critères de sélection des articles pour le bulletin

Parmi les articles retenus, une trentaine sont sélectionnés pour figurer dans la liste « À ne pas manquer » présente dans le bulletin de veille scientifique Covid-19.

La sélection des articles est effectuée en fonction de leur pertinence et des priorités en santé publique. En particulier, sont privilégiés :

  • Les articles, lettres scientifiques ou correspondances apportant de nouvelles connaissances susceptibles d’orienter l’intervention de santé publique ou répondre à des questions d’actualité;
  • Les méta-analyses, revues systématiques et revues de littérature;
  • Publications et prépublications en français ou en anglais.

La collecte d'information

L’agrégateur de flux RSS Inoreader est utilisé pour collecter de manière automatique et en continu les nouvelles publications et prépublications provenant des sources d’information énumérées à la section « Liste des sources », ci-bas. Des outils tels que FetchRSS, Wachete, etc. sont aussi utilisés pour les sources d’informations qui ne diffusent pas de flux RSS.

Les résultats de certaines sources sont d’abord filtrés à l’aide d’Inoreader avant d’être triés. Les résultats de certaines sources sont également dédoublonnés en partie de manière automatique par Inoreader et en partie par une intervention quotidienne de l’équipe de la documentation.

Les filtres et stratégies de recherche utilisés dans le cadre de la veille scientifique COVID-19 sont disponibles sur demande à l’adresse abonnements@inspq.qc.ca

Liste des sources

L’essentiel des sources de la veille scientifique sur la COVID-19 est constitué de bases de données de publications et de prépublications scientifiques. S’y ajoute un ensemble de périodiques scientifiques, d’éditeurs scientifiques et de sites web d’organisations diffusant des informations d’intérêts en lien avec la COVID-19. Ces sources supplémentaires sont suivies pour différentes raisons : parce que leurs publications ne sont pas indexées par les bases de données suivies, parce qu’elles diffusent les publications plus rapidement (que les bases de données), etc.

Bases de données
  • Pubmed
  • EMBASE (Ovid)
  • MedRxix
  • BioRxiv
Revues/éditeurs scientifiques
  • Anesthesia & Analgesia
  • Annals of Work Exposures and Health
  • British Medical Journal (BMJ)
  • BMJ Open
  • Canadian Journal of Anesthesia
  • Canadian Medical Association Journal (CMAJ)
  • BMJ Case report
  • BMJ Global Health
  • CDC - Morbidity and Mortality Weekly Report
  • Cell
  • China CDC Weekly
  • CIDRAP - All News
  • Clinical Infectious Diseases
  • CMAJ Open
  • Cochrane Database of Systematic Reviews
  • Emerging Infectious Diseases – CDC
  • European Journal of Obstetrics & Gynecology and Reproductive Biology
  • Eurosurveillance
  • Experimental Biology and Medicine
  • Global Public Health
  • Infection Control and Hospital Epidemiology
  • International Journal of Infectious Diseases
  • JAMA Internal Medecine
  • JAMA Online First
  • Journal of Clinical Investigation
  • Journal of Clinical Medicine
  • Journal of Engineered Fibers and Fabrics
  • Journal of Epidemiology and Community Health
  • Journal of Hospital Infection 
  • Journal of Medical Virology
  • Journal of Occupational and Environmental Hygiene
  • Journal of Pediatrics
  • Journal of the Pediatric Infectious Diseases Society
  • Journal of Travel Medicine
  • Nature
  • Nature Communications
  • NICE Guidance and Advice List
  • Pediatrics
  • Photodermatology, Photoimmunology & Photomedicine
  • Preprints with The Lancet
  • PLOS Medicine
  • PLOS ONE
  • Proceedings of the National Academy of Sciences
  • Relevé des maladies transmissibles au Canada (RMTC)
  • Revue d’Épidémiologie et de Santé Publique
  • Science
  • Science China Life Sciences
  • Science of the Total Environment
  • Scientific Reports – Nature
  • The Lancet - Coronavirus
  • The New England Journal of Medicine

 


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